Generasi kedua mempertanyakan alasan kenapa The Anonymous masih belum melancarkan serangan kepada mereka secara langsung bahkan setelah mengetahui kalau mereka adalah ancaman tersebar di seluruh alam semesta karena telah mengalahkan beberapa Anonymous dan satu The Gods dari Anonymous Kise, selain King of Kings.

Dalam beberapa pertemuan yang dipimpin oleh Rez (Student Council President), hal ini sering kali dibahas secara terbuka oleh generasi kedua, namun pada akhirnya hanya menghasilkan kesimpulan berupa Mereka memberikan kita kesempatan. Pada akhir cerita setelah masing-masing dari mereka berhasil mengalahkan perasaan takut akan masalah pribadi yang belum terselesaikan, kini mereka kembali mengadakan sebuah pertemuan yang akan membahas secara jelas Tujuan dari The Anonymous membiarkan mereka tetap bertahan.

Mereka melakukan diskusi secara serius –team. Bagian informasi secara langsung akan dikumpulkan oleh Kagami, dilengkapi dengan Himeka sebagai investigator yang akan mencari informasi secara tidak langsung. Mereka berdua melakukan pencarian hingga ke delapan alam semesta berbeda. Setelah informasi mentah itu didapat, Hikari yang merupakan database akan menyusunnya secara terstruktur agar mudah dilihat dan dianalisis. Melalui kemampuan deduksi dari D-san dan Tio, mereka akhirnya mendapatkan sebuah kesimpulan dengan presentasi kebenaran sebesar 89%. Dengan adanya kesimpulan itu, Maykie memperlihatkan gambarannya dari alasan mengapa Anonymous tidak melancarkan serangan.

Kesimpulan yang mereka dapat adalah adanya paradox di alam semesta parallel, di mana alam semesta ini terbungkus sangat rapi di antara semesta lain sehingga teknologi yang mereka dapat dari Shina tidak dapat menembusnya. Dengan paksaan dan galat yang cukup besar, mereka mencoba menembus alam semesta itu, tapi nyata-nya hanya batin mereka yang bisa sampai ke permukaannya.

Alam semesta Parallel sudah terkontaminasi dengan keputusasaan besar yang diciptakan oleh Kaidou. Di mana singkatnya, Paradox di tempat itu diberikan sebuah masalah besar yang akan mematikan tiap makhluk yang hidup di sana secara perlahan menggunakan tiap keputusasaan yang bangkit sebagai penyakit. Keputusasaan ini berpedoman pada sebuah kitab yang telah hilang bernama Grimoire of Despair.

Melalui hubungan sebab-akibat, generasi kedua menyimpulkan jika mereka diam-diam telah terikat erat dengan hubungan itu. Tanpa disadari bahwa The Anonymous akan membunuh mereka tanpa harus mengotori tangan secara langsung di mana sebab-akibat yang dihasilkan adalah “Jika 41 Paradox yang terpilih mati, maka 41 Siswa Original akan lenyap dengan sendirinya.”

Akhirnya, dengan memanfaatkan kesempatan melalui batin yang dipindahkan sampai ke permukaan alam semesta parallel. Salah satu dari mereka dipilih, Maaya memutuskan untuk masuk berbicara kepada pengawas alam semesta yang kebetulan paling dekat dengan jangkauan batinnya. Dengan penuh harapan besar, ia menjelaskan setiap keadaan secara baik-baik, kondisi alam semesta yang mereka tinggali, lalu memberikan big data mengenai ciri-ciri generasi kedua dan menjelaskan secara singkat mengenai paradox yang berkebalikan besar-kecil terhadap aslinya. Ia kemudian menyarankan untuk melakukan apa yang seharusnya dilakukan di mana paradox yang terikat dengan generasi kedua harus dikumpulkan di suatu tempat, yaitu akademi itu sendiri Guilty Sky Academy yang diciptakan seadanya.

Informasi itu sampai tepat kepada paradox dari salah satu generasi kedua GSA, Ren. Dengan adanya persentase lebih banyak kepercayaan daripada keraguan, Atria sebagai paradox pertama yang diketahui mencari solusi untuk menemukan sisa paradox generasi kedua yang lain dan mengumpulkan di Guilty Sky Academy. Tentu saja dengan bantuan sebuah sistem yang mampu mengindentifikasi 70% kepikiran antara Paradox dan Original-nya. Ini tidak akan mudah mengingat alam semesta tersebut memiliki jangkauan yang sangat luas.

Mampukah para paradox bersatu dan bertahan hidup di tengah-tengah keputusasaan?